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文檔簡介
1、實驗一CTAB法提取植物基因組DNA實驗的目的:學習從植物組織中提取基因組DNA的基本原理和方法。實驗原理:用機械研磨的方法粉碎植物的組織和細胞,植物細胞的勻漿中含有很多酶類(特別是氧化酶類),會對DNA的提取產生不良影響,所以在提取緩沖液中添加抗氧化劑和強還原劑(如巰基乙醇),使這些酶類的活性降低。 在液氮中研磨,材料容易損壞,研磨中各種酶類的作用減少。CTAB (hexadecyltrimethylamioniumbromide,十六烷基三甲基溴化銨)是一種陽離子除污劑,能溶解細胞膜,與核酸形成復合體。該復合體在高鹽溶液中(0.7mol/L NaCl )可溶,用有機溶劑提取除去蛋白、多糖類
2、、酚類等雜質后,加入乙醇沉淀(CTAB可溶于乙醇)就能分離核酸。由于CTAB溶液在低于15度時會沉淀溶出,所以在加入冷植物材料之前必須進行預熱(65度),離心溫度不能低于15度。實驗步驟:取年輕植物的葉子(3-5g )將液氮粉碎,放入離心管內1.5ml。 加入同體積的65預熱的DNA提取緩沖液,在65的恒溫水浴床上放置1-2h(1.5h )。加入2,等體積的氯仿:異丙醇(24:1 ),輕輕上下顛倒5分鐘,靜置5分鐘,然后以12000rpm離心10分鐘。3、吸取上層水相,重復步驟2一次。4、吸入上層水相,加入預冷的2/3體積的異丙醇,輕輕翻轉2分鐘,放入-20的冰箱10分鐘,DNA沉淀后以120
3、00rpm離心收集,收集到的DNA用70%乙醇洗23次。 扔掉乙醇,在風干的DNA中加入適量的水使之溶解。5、DNA完全溶解后,加入不含RNAasea的12l(10mg/ml ),在37下保溫1h,去除DNA中的RNA。6、在Eppendorf管中加入1mL氯仿:異丙醇(24:1 ),輕輕上下反轉10分鐘后,以10000rpm離心10分鐘。7、吸入上層水相,加入1/10體積的3M乙酸鈉和2倍體積的預冷無水乙醇,放入-20冰箱中,10分鐘后以10000rpm離心10分鐘,丟棄無水乙醇,加入70%乙醇洗滌23次,風干,最后8.DNA完全溶解后,進行1%瓊脂糖凝膠電泳,檢查DNA的質量,根據已知的D
4、NA分子量標準來估計其濃度。 調整過濃度的DNA在-20下預備使用。實驗試劑:1,1米三級HCl (ph8.0)121.1g Tris溶解于800ml無菌水中,加入HCL將pH調節(jié)到8.0,定容調節(jié)到1L,進行高壓滅菌。2,0.5m EDTA (ph 8.0 )186.1g EDTA-Na2H2O溶解于800ml無菌水中,用磁力攪拌器激烈攪拌,用NaOH將pH調節(jié)到8.0 (約20g ),定容至1L,進行高壓滅菌。3,3.5m NaCl204.75g NaCL溶解于1L無菌水中,進行高壓滅菌。4,10 % CTAB溶液10gCTAB溶解于80ml無菌水中,定容至100mL,進行高壓滅菌。5、DNA提取液(500ml )3.5米NaCl200毫升TRISS-HCl50毫升PS50毫升10 % PS100毫升Water100毫升6、氯仿-異丙醇(24:1體積比)七、RNA東盟8、異丙醇9、無水乙醇10,3m乙酸鈉11、1TE緩沖液實驗器具:液氮罐,離心管1.5ml,離心架1.5ml,恒溫水浴床,槍和槍口(1ml和200ul ),離心分離機(轉速可調整為4000rpm和10000rpm ),剪刀注意事項(1)葉片越磨越好。(2)移液管的使用
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