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文檔簡介
1、堿裂解法提取質(zhì)粒DNA,1,PPT學(xué)習(xí)交流,通過質(zhì)粒的一些特性、質(zhì)粒DNA的提取、測定,學(xué)習(xí)用堿變性法提取質(zhì)粒DNA的方法,掌握堿裂解法提取質(zhì)粒DNA的原理及操作。,一、實驗?zāi)康?2,PPT學(xué)習(xí)交流,質(zhì)粒(Plasmid) : 質(zhì)粒是細菌細胞內(nèi)一種自我復(fù)制的環(huán)狀雙鏈DNA分子,能穩(wěn)定地獨立存在于染色體外,并傳遞到子代,一般不整合到宿主染色體上。 在細胞內(nèi)它們常以共價閉環(huán)的超螺旋形式存在。存在于細菌、放線菌、真菌以及一些動植物細胞中,在細菌細胞中最多。,二、實驗原理,3,PPT學(xué)習(xí)交流,4,PPT學(xué)習(xí)交流,質(zhì)粒已成為目前最常用的基因克隆的載體分子,具有以下特點: 易于鑒定; 在受體細胞中可以獨立
2、復(fù)制; 易于篩選; 易于導(dǎo)入受體細胞。,5,PPT學(xué)習(xí)交流,二、實驗原理,6,PPT學(xué)習(xí)交流,SDS是一種陰離子表面活性劑,它既能使細菌細胞裂解,又能使一些蛋白質(zhì)變性,所以SDS處理細菌細胞后,會導(dǎo)致細菌細胞壁的破裂,從而使質(zhì)粒DNA以及基因組DNA從細胞中同時釋放出來。釋放出來的DNA遇到強堿性(NaOH)環(huán)境,就會變性。然后,用酸性乙酸鉀來中和溶液,使溶液處于中性,質(zhì)粒DNA將迅速復(fù)性,而基因組DNA,由于分子巨大,難以復(fù)性。離心后,質(zhì)粒DNA將在上清中,而基因組DNA則與細胞碎片一起沉淀到離心管的底部。通過這種方法即可將質(zhì)粒DNA從細菌中提取出來。,7,PPT學(xué)習(xí)交流,三、主要試劑及作用
3、,溶液:由葡萄糖、EDTA、Tris-HCl組成 (保護、緩沖) 葡萄糖的作用是增加溶液的粘度,減少抽提過程中的 機械剪切作用,防止破壞質(zhì)粒 (保護作用) EDTA 的作用是絡(luò)合掉鎂等二價金屬離子, 防止DNA酶對質(zhì)粒分子的降解作用(保護作用) Tris-HCl 使溶菌液維持溶菌作用的最適PH范圍(緩沖作用),8,8,PPT學(xué)習(xí)交流,溶液II:由SDS(十二烷基硫酸鈉)與 NaOH 組成(裂解、變性) SDS的作用是解聚核蛋白并與蛋白質(zhì)分子結(jié)合使之變性(裂解細胞和蛋白質(zhì)變性作用) NaOH(PH12)的作用是破壞氫鍵,使DNA分子變性(DNA變性作用),9,9,PPT學(xué)習(xí)交流,溶液III:HA
4、c和 KAc組成的高鹽溶液 (復(fù)性,分離) HAc溶液能中和溶液的堿性,使染色體DNA 變性而發(fā)生纏繞,并使質(zhì)粒DNA復(fù)性。 KAc會與SDS形成溶解度很低的鹽,并與蛋白質(zhì)形成沉淀而除去;溶液中的DNA也會與蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物纏繞成大分子而與小分子質(zhì)粒DNA分離。,10,PPT學(xué)習(xí)交流,四、試劑配制 溶液:50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。 1M Tris-HCl(pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。高壓滅菌15min ,貯存于4。 溶液:0.2N
5、NaOH,1% SDS。2N NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH2O至10ml。使用前臨時配置。 3. 溶液:醋酸鉀(KAc)緩沖液,pH 4.8。5M KAc 300ml,冰醋酸 57.5ml,加ddH2O至500ml。4保存?zhèn)溆谩?11,PPT學(xué)習(xí)交流,4. TE:10mM Tris-HCl(pH 8.0),1mM EDTA(pH 8.0)。1M Tris-HCl(pH 8.0)1ml,0.5M EDTA(pH 8.0)0.2ml,加ddH2O至100ml。15 lbf/in2高壓濕熱滅菌20min,4保存?zhèn)溆谩?5. 苯酚/氯仿/異戊醇(25:24:1) 6. 乙醇(無水乙
6、醇、70%乙醇) 7. 5TBE:Tris 堿54g,硼酸27.5g,EDTA-Na22H2O 4.65g,加ddH2O 至1000ml。15 lbf/in2高壓濕熱滅菌20min,4保存?zhèn)溆谩?8. RNase A(RNA酶A):不含DNA酶(DNase-free) RNase A的10mg/ml,TE配制,沸水加熱15min,分裝后貯存于-20。,12,PPT學(xué)習(xí)交流,實驗步驟,加1.5ml培養(yǎng)物于EP管,12000g30S 除去上清,加入冰的200 l 溶液I,劇烈振蕩EP管,室溫3min 加入300l 溶液II,快速顛倒數(shù)次,冰浴3min 加入400l 冰溶液III,溫和振蕩10s,冰浴5min,12000g5min 轉(zhuǎn)移上清到新EP管,加入等體積酚/氯仿(1:1),溫和振蕩,冰浴3min,12000g5min 上層水相轉(zhuǎn)移到新EP管,加入2倍體積無水乙醇,顛倒混勻,
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