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文檔簡介
1、,第4章 孟德爾式遺傳分析,在18571864年間,孟德爾成功地進行了舉世聞名的豌 豆(Pisum sativum)雜交實驗,在其論文發(fā)表35年之后,3位 植物學(xué)家最終于1900年重新發(fā)現(xiàn)孟德爾定律,這標(biāo)志著遺傳 學(xué)現(xiàn)代紀(jì)元的開端。,孟德爾定律通常分為分離定律和自由組合定律,它是現(xiàn)代,遺傳學(xué)的基礎(chǔ)和經(jīng)典遺傳學(xué)的核心。,經(jīng)歷了108年的發(fā)展,當(dāng)今的遺傳學(xué)已成為生命科學(xué)的核 心。談家楨先生曾生動而形象地將遺傳學(xué)比喻為一棵根深葉茂 的大樹,孟德爾定律便是具有頑強生命的種子,由摩爾根等人 建立起來的細胞遺傳學(xué)則是這棵巨樹的主干。,本章的主要內(nèi)容:孟德爾遺傳的基本規(guī)律及其擴展。 要點:孟德爾遺傳分析的基
2、本原理與方法,基因在動物、,植物乃至人類的繁衍過程中的表現(xiàn)及其傳遞規(guī)律。,補充,遺傳學(xué)的基本術(shù)語(重要的名詞),1、遺傳性狀(Hereditary traits) 一個個體從親代傳遞到下一代的特性(孟德爾稱為Characters) 2、基因(Gene): (Mendelian factor) Physical and functional unit of heredity,which carries information from one generation to the next.In molecular terms, a gene is the entire DNA sequence
3、necessary for the synthesis of a functional polypeptide or RNA molecular. In addition to coding regions most genes also contain noncoding intervening sequences (introns) and transcription- control regins. 攜帶從一代到下一代信息的遺傳的物質(zhì)單位和功能單位。按分子術(shù) 語講,一個基因是合成一條有功能的多肽或RNA分子所必須的完整的 DNA序列。除了編碼區(qū)外,大多數(shù)基因也包含非編碼的間插序列和轉(zhuǎn)錄
4、控制區(qū)。,3、基因座(Locus,復(fù)Loci):,The specific place on a chromosome where a gene is located; the position of a gene on a genetic map.,基因在染色體上的特定位置/基因在遺傳學(xué)圖上的位置。 4、基因型(Genotype): 一個生物個體的遺傳組成,包括一個個體的所有的基因。,5、表現(xiàn)型(Phenotype):,一個生物個體由基因型與環(huán)境相聯(lián)系所產(chǎn)生的可觀察到的,特性。包括一個個體各種基因所產(chǎn)生的產(chǎn)物,如蛋白質(zhì)、酶等,,以及個體的各種特征表現(xiàn),甚至它的行為等等。,由于環(huán)境和其他基因的
5、影響,導(dǎo)致:具有相同基因型的一些個體,可能會有不同的表現(xiàn)型,或具有相同表型的一些個體可能有不同,基因型。,6、等位基因(Alleles): 位于一個基因座上的一個或多個基因的替換形式(alternative forms of a gene),通過它們對表型的不同影響而加以區(qū)別。 或:在同源染色體上基因座相同,控制相對性狀的基因。 7、顯性和隱性(Dominant and recessive) 孟德爾把相對性狀中能在F1顯現(xiàn)出來的叫顯性,不表現(xiàn)出來的叫隱性。 顯性基因?qū)﹄[性基因具有掩蓋作用,隱性基因在雜合體中不能表現(xiàn) (Aa),只能在純合狀態(tài)時才能表現(xiàn)(aa),而顯性基因在純合和雜合狀態(tài) 時都能
6、表現(xiàn)其性狀(AA或Aa)。,8、野生型與突變型(Wild type and mutant type),野生型也叫正常型,是指生物體在自然界中出現(xiàn)最多的類型(基因型或表,現(xiàn)型),或某一生物用作標(biāo)準(zhǔn)實驗種的基因型或表現(xiàn)型。,突變型是由野生型基因突變而來,即突變體,突變型基因用所說明的基因,名稱的英文略字表示。例如果蠅的黃體突變型基因用Y(yellow)表示,而野,生型基因則用表示,或用Y表示。,4.1,分離定律及其遺傳分析,4.1.1 孟德爾的豌豆雜交實驗 豌豆:雙子葉植物、閉花 授粉,因而每株豌豆子代性 狀與親代的遺傳一致性極 高,將這種品系(strain) 稱為純種(true-breeding
7、) 或 稱 真 實 遺 傳 。 七對相對性狀 種皮的顏色 種子的形狀 花的顏色 未成熟豆莢的顏色 成熟豆莢的形狀 莖的高度 花的位置,4.1.2 單因子雜交實,驗及其分析,用帶有一對相對性狀差別,的純合等位基因品系(true- breeding strains)進行雜 交,這樣的交配稱為單基因 雜種雜交(monohybrid,crosses),揭示了遺傳的第 一個規(guī)律分離規(guī)(Law of segeragation),例種子形狀 圓形 皺形 相 對性狀,P RR rr,分離比3:1在第一代 ( First filial,generation, F1 )中,看不出來,因為有顯 隱關(guān)系,顯性對隱性
8、的掩蓋作用,在第二 代才能看出。,注意:F1是由雜交得,到的,稱雜種一代,F2是自交得來的,稱,子二代,(1)F1只表現(xiàn)出一個親本的性狀,例如:圓形種子,黃色子葉、高莖等等,因而表現(xiàn)整齊一致。,孟德爾將表現(xiàn)出來的親本性狀叫做顯性性狀,沒表現(xiàn)出來的親本性狀叫做隱性,性狀。,(2)F1自交,在子二代群體中,親本的相對性狀又分別表現(xiàn)出來,例如,F(xiàn)2既有圓形種子又有皺形種子,即顯性性狀和穩(wěn)性性狀同時表現(xiàn)出,來 ,變得不一致了,這種現(xiàn)象叫做性狀分離(Character segregation),(3)在子二代的群體中,具有顯性性狀的個體和具有隱性性狀的個體數(shù),常是,一定的分離比,而且都很接近3:1,以上
9、試驗,在F1植株上所結(jié)的豆莢,每個豆莢可能結(jié)兩類種子:圓形、皺,形,在一個豆莢中兩種類型的種子都有時,圓形是多數(shù),而皺形是少數(shù)。,正反交,也稱互交(reciprocal cross) 即 圓(雌)皺(雄)和 皺(雌)圓(雄) 正反交結(jié)果所得到的F1性狀表現(xiàn)完全一致 注意:若為細胞質(zhì)控制的性狀,正反交結(jié)果是不一致的。 上述結(jié)果顯示出三個有規(guī)律的共同現(xiàn)象:,孟德爾的解釋 對上述試驗結(jié)果提出如下解釋(這也是分離法則的要點),(1)性狀是由遺傳因子(genetic factor)控制的,相對性狀是由,細胞中相對遺傳因子控制(遺傳因子控制性狀的發(fā)育);,(2)遺傳因子在體細胞中是成對的,一個來自母本,一
10、個來自父,本,在形成配子時,成對的遺傳因子彼此分離,并且各自分配到,不同的配子中去。每一個配子,只含有成對因子中的一個(配子,是純粹的);,(3)雜種F1體細胞內(nèi)的遺傳因子,各自獨立,互不混合(融 合),彼此保持獨立的狀態(tài),但對性狀的發(fā)育卻互有影響,從而,表現(xiàn)為顯性和隱性(因子作用的顯隱性)。,圓豌豆與皺豌豆的分子解釋 1940年 提出基因決定酶的形成 1991年 英國一個遺傳學(xué)家鑒出決定豌豆種子 圓形或皺形的基因(分子本質(zhì)),Dominant,allele R, starch-branching enzyme 1 ,Amylose - amylopectin,直鏈淀粉,支鏈淀粉,皺豌豆,圓豌
11、豆(吸水性強)410,4.1.3,分離定律,principle of segregation Mendels First law The two members of a gene pair (alleles) segragate (separate) from each other in the formation of gametes;half the gametes carry one allele, and the other half carry the other allele. 在形成配子時一個等位基因的兩個成員彼此分離,結(jié)果 一半配子攜帶一個等位基因,另一半配子攜帶另一個等位基
12、 因。 解釋:每一對同源染色體來自父本一條,母本一條,假設(shè)等 位基因A,等位基因a,減數(shù)分裂,同源染色體分離 (基因的分離是染色體分離的結(jié)果),等位基因分離的驗證,(1)、測交驗證,測交(Test cross):是用來測驗雜種基因型的一種雜交,方法,用F1與隱性純合類型雜交。,孟德爾測交試驗的結(jié)果和他預(yù)期的完全相會,從而證實了F1,在形成配子時等位基因的分離,證實了他的理論分析是正確的。,以上的測交中,一對基因的雜種,總是與其隱性親本(rr),進行雜交,這種雜交方式也叫做回交(backcross)。,415,2、自交驗證(selfed/selfing),通過自交后代的類型和數(shù)目來推論親本的情況
13、。,基本方法:以F2分別自交產(chǎn)生F3,然后根據(jù)F3的表型類型及比 例,驗證所設(shè)想的F2基因型,從而推知F1在形成配子時,等位基 因是否分離。,F2具顯性性狀的類別進行自交(RR 1/3 , 2Rr 2/3),分別觀察七個單位性狀,結(jié)果F2自交群體中,1/3的個體所產(chǎn)生的后代保持穩(wěn)定的顯性性狀 具有性狀分離的和具穩(wěn)定遺傳個體的比例為2:1,2/3的個體所產(chǎn)生的后代顯性:隱性3:1 分離,豌豆F2顯性性狀個體自交所得F3的各種表現(xiàn)型數(shù)目,這一結(jié)果表明,具有顯性性狀的F2群體中,有2/3左右的個體基因型為 雜合型,有1/3左右的個體基因型為純合型。這樣,就證實了孟德爾對F2基 因型的設(shè)想,進而證實了
14、F1在形成配子時等位基因的分離。,分離比實現(xiàn)的條件,(1)子一代個體形成的兩種配子的數(shù)目是相等的,它們的生,活力是一樣的,(2)子一代的兩種配子的結(jié)合機會是相等的,(3)3種基因型個體的存活率到觀察時為止是相等的 (4)顯性是完全的。,分離法則的普遍意義,動物、植物、微生物、以及人類,4.2,自由組合定律及其遺傳分析,4.2.1 雙因子雜交實驗及自由組合定律 孟德爾進行了兩對相對性狀的豌豆雜交實驗 豌豆種子 兩對性狀 第一對 黃色和綠色 第二對 圓形和皺形 P 黃色圓形 綠色皺形,黃色圓形,(說明黃、圓為顯性),F1 F2,總數(shù) 556粒,黃圓 315粒 (9/16),黃皺 101粒 (3/1
15、6),綠圓 108粒 (3/16),綠皺 32粒 (1/16),子二代,四種類型,黃圓 綠皺,黃皺 綠圓,分別和兩個親本中的一個親本相同親組合類型 與親本不同的新類型重組合類型 而且這4種表現(xiàn)型存在著一定的比例關(guān)系:9:3:3:1, 親組合,parental combination, 重組合類型 recombination,獨立分離和自由組合,怎樣解釋9:3:3:1這個比例?孟德爾將這兩對性狀折開,,分別只考察其中的一對,在總共556粒種子中:,黃416粒315粒 黃圓101粒 黃皺 綠140粒108粒 綠圓32粒 綠皺,所以 從顏色上看 黃色:綠色416:1402.97:1=3:1,再考察種
16、子的形狀:,圓:423粒315粒黃圓108粒綠圓 皺:133粒101粒黃皺32綠皺,所以 圓形:皺形423:1333.18:13:1,可見,在分別只考察其中一對性狀時,F(xiàn)2仍然各自呈3:1的,分離,所以這兩對性狀是獨立遺傳的,各自按分離法則分離,相 互之間不發(fā)生影響,兩對性狀之間的組合完全自由。,以上結(jié)果說明:,(1)決定兩對相對性狀的兩對基因在F1雜合子中(YyRr)互,不混淆,各自保持其獨立性,這實質(zhì)上是孟德爾的顆粒遺傳 (particulate inheritance)理念的進一步體現(xiàn)。說明遺 傳絕不是“融合式”的。遺傳學(xué)的發(fā)展愈來愈顯示遺傳的顆 粒性理念的正確性和重要性。,(2)F1植
17、株形成雌、雄配子時,每對等位基因Y、y(或R、r,)的分離都是獨立的,分別進入不同的配子,不同對的基因 則自由組合。所產(chǎn)生的4種基因型的配子(雌或雄)在數(shù)量 上是相等的,其比率勢必為1:1:1:1。,P62 第2段 第4行,孟德爾第二定律-自由組合定律,Mendels second law ,the principle of independent assortment, states that genes for different traits assort independently of one another in the production of gametes,不同對的遺傳因子
18、在形成配子中自由組 合(independent assortment)。自由組合 定 律 又 叫 獨 立 分 配 定 律 ( law of independent assortment )。,孟德爾第二定律的驗證,孟德爾兩對基因雜種測交結(jié)果:四種類型 RrYy,Rryy,rrYy,rryy比例 1:1:1:1,F1測交,孟德爾測交試驗的結(jié)果和他預(yù)期,的結(jié)果完全相符,從而證實了F1在形,成配子時等位基因分離,非等位基因 自由組合,證實了他的理論分析是正 確的。,P63 知識窗41,遺傳學(xué)與遺傳命名法,英國遺傳學(xué)進展編輯部編輯的 TIG遺傳命名指南于2000年出版發(fā)行 不同生物的遺傳命名規(guī)則有別,
19、常用的模式生物有各自標(biāo)準(zhǔn)化的基因 (或基因產(chǎn)物)符號、書寫方式和命名規(guī)則與方法 例如果蠅的基因命名規(guī)定一般有:英文az字母的斜體表示隱性突 變基因,非野生型等位基因用上標(biāo)“”號表示;用英文AZ字母的斜體 表示顯性等位基因,野生型基因用上標(biāo)“”號標(biāo)出。用相應(yīng)的基因符號 命名其產(chǎn)物(蛋白質(zhì)或其他)時,需要大寫,正體。連鎖著的基因的 基因型符號用斜線隔開,如yw sn3YW Sn3;非同源染色體上的基因 用分號或空位分開,如bw;e等等。黑腹果蠅中的4對染色體用斜體阿 拉伯?dāng)?shù)字命名(對于X染色體而言,符號1與X是同義的),如X(或1) ,2,3,4和Y。由表示染色體結(jié)構(gòu)變異類型的英文前綴來命名,如T
20、 (translocation),In(inversion),Df(deficiency),Dp( duplication)等等。而細菌的基因符號則由3個小寫斜體的字母組成,如 組氨酸基因以his表示,色氨酸基因以trp表示;用hisA表示某一組氨酸缺 陷型基因;hisA則表示相應(yīng)的野生型基因等等。,4.3 遺傳學(xué)研究中的統(tǒng)計方法,孟德爾 進行,遺傳分析,重大成功歸于統(tǒng)計學(xué)方法,3:1或1:1只是當(dāng)個體數(shù)相當(dāng)多時比較接近而已,個體數(shù)目少時,實得 結(jié)果與理論常常有明顯的偏差。,例:黃豌豆,綠豌豆, 258株F1,8023粒F2種子 其中黃6022粒,綠2001粒 總起來看接近3:1,圓,皺, 2
21、53株F1,7324粒F2種子 其中5474粒圓,1850粒皺,總數(shù)也接近3:1 但若分別觀察每一株F1所結(jié)的F2種子,實得比例同理論預(yù)期往往有相當(dāng) 大的偏差,從下表可以看出,每一株F1所結(jié)的F2種子與理論比例(3:1) 都有一定的偏差。,最極端的分離比 32黃:1綠和20黃:19綠 43圓:2皺和 14圓:15皺(表中未列)同3:1極不符合。 孟德爾試驗中F1單株的分離比數(shù),黃綠,F2種子,圓皺,F2種子,F1株號 1 2,黃 25 32,綠 11 7,F1株號 1 2,圓 45 27,皺 12 8,3 4 5 6 7 8 9 10,3 4 5 6 7 8 9 10,14 5 70 27 2
22、4 13 20 6 32 13 44 9 50 14 44 18 355 123,24 19 32 26 88 22 28 25 336,7 16 11 6 24 10 6 7 107,2.88:1,3.14:1,但若把各株F1所結(jié)的F2種子累加起來,便 可發(fā)現(xiàn)在F2中顯性種子的比例始終在0.750 (即3/4)左右波動,而且隨著F2種子數(shù)目的,增加,偏差愈來愈小,比例逐漸逼近3:1,,所以說F2種子中顯性種子的出現(xiàn)概率是0.750,(即3/4),或者說,基因的分離是一種機率 (概率)現(xiàn)象。,(1)概率 概率(probability):是指在反復(fù)試驗中,預(yù)期某一 事情的出現(xiàn)次數(shù)的比例?;蛘哒f是
23、指某一事情發(fā)生的可能性 的大小。 某一事情:事物的某種情況或試驗中獲得的某種結(jié)果。,例:事情A發(fā)生的可能性大小,P(A),n次試驗,某一事件在n次試驗中平均發(fā)生m次,這一事 情的概率:m/n。 概率是0到1之間的一個分數(shù)。 概率所代表的是一件事情即將發(fā)生的平均趨勢。 例如:向空中拋硬幣,落下時,得到的正面和反面的次數(shù), 二者出現(xiàn)的機會都是1/2。,(2)加法定律(sum rule),加法定律是與計算兩個或兩個以上互斥事件 (mutually exclusive events)的概率有關(guān)的定 律。,互斥事件:指二者不能同時出現(xiàn)的事件。,兩個互斥事件中,出現(xiàn)任一事件的概率是它們各自 概率的和 :
24、P(A或B)P(A)P(B),例:一粒豌豆的顏色,不可能既是黃色又是綠色, 在這里兩者是互斥事件,是黃色或綠色的概率是它 們各別概率之和即:1/2+1/2=1,(3)乘法定律(product rule) 兩個或兩個以上的獨立事件同時出現(xiàn)的概率是它們各自概率的乘積。,P(AB)P(A)P(B),一個事件的發(fā)生對另一個事件發(fā)生的概率沒有影響,這兩個事件就是獨立事件。,例:我們用甲、乙兩個硬幣同時上拋,問甲、乙同時都出現(xiàn)正面或都出現(xiàn)反面的,概率是多少?,1/21/2=1/4(兩件獨立的事件同時發(fā)生的機會是這兩件事件的概率的乘積),同理:甲正、乙反或甲反、乙正的概率也各為1/4。,即:甲乙兩硬幣同時出
25、現(xiàn)正面的概率:1/21/21/4,相同面,甲乙兩硬幣同時出現(xiàn)反面的概率:1/21/21/4,甲乙兩硬幣出現(xiàn)一正一反的概率:1/21/21/4,一正一反,甲乙兩硬幣出現(xiàn)一反一正的概率:1/21/21/4 以上四種情況(組合),各種情況間(組合)都是互斥事情。,(4)遺傳比例的計算,基因型、表現(xiàn)型的數(shù)目的計算和表示法,1)、棋盤法(punnett seqnare) 一對基因雜種的遺傳分析 例:Aa Aa 基因型為Aa的雜種,形成配子,等位基因分離,兩種配子A a 概率 1/2 1/2,當(dāng)自交時,即AaAa,雌雄配子各作為獨立事情相遇的概率,按乘法定律:,有四種組合,1/2 A 1/2 A=1/4
26、AA 1/2 A 1/2 a=1/4 Aa 1/2 a 1/2 A=1/4 aA 1/2 a 1/2 a=1/4 aa,Aa,Aa,用棋盤法表示: 配子概率 1/2 A 1/2 a, 1/2A,1/2a 1/2 A 1/4 AA 1/4 aA, 1/2A,1/2a 1/2 a 1/4 Aa 1/4 aa,從棋盤中看出,AaAa具四種可能的合子,其概率各為1/4。 不同合子的產(chǎn)生是互斥事情, 按加法定律,不分基因先后順序,,則,Aa和aA基因型的概率:1/4 + 1/4 =1/2,帶顯性(A)基因的合子的概率:P(AA或Aa或aA)1/4+1/4+1/4=3/4 帶aa合子的概率:1/4 四種組
27、合合子的總概率:3/4+1/41 A表型:a表型3/4:1/4=3:1,Aa,一對基因相差時,有6種交配方式。每種交配所 產(chǎn)生的子代的基因型和表型都有所不同 AA,11aa1,1Aa,1A:1a,(2)兩對基因雜種的遺傳分析,例:RrYy,RrYy,RrYy產(chǎn)生四種類型的配子,其概率各為1/4,1/4RY,1/4Ry,1/4rY,1/4ry,1/4RY 1/4Ry 1/4rY 1/4ry,1/16RRYY 1/16RRYy 1/16RrYY 1/16RrYy,1/16RRYy 1/16Rryy 1/16RrYy 1/16Rryy,1/16RrYY 1/16RrYy 1/16rrYY 1/16r
28、rYy,1/16RrYy 1/16Rryy 1/16rrYy 1/16rryy,9種基因型 4種表現(xiàn)型,比例為9:3:3:1,2)分枝法(branching,process method /branching idogram),兩對以上基因雜種的遺傳分析 棋盤法繁瑣 4n 分枝法簡便 例:AaBbCc的自交,AaBbCc AaBbCc 可將它的每對基因分別考慮 即AaAa BbBb CcCc 每一組合都產(chǎn)生三種不同的基因型,其比率是1:2:1 每一組合都產(chǎn)生兩種表現(xiàn)型,比率是3:1 按照它們各自的概率相乘起來,便是子代的基因型和表現(xiàn)型,,具體如下:,AaBbCc,AaBbCc,表現(xiàn)型,Aa A
29、a,Bb,Bb,Cc Cc,(8種),表型,簡化,3/4A 1/4a,3/4B 1/4b 3/4B 1/4b,3/4C27/64A B C 1/4c = 9/64A B CC 3/4C = 9/64A bbC 1/4c = 3/64A bbcc 3/4C = 9/64aaB C 1/4c = 3/64aaB cc 3/4C = 3/64aabbC 1/4c = 1/64aabbcc,27ABC 9ABC 9AbC 3Abc 9aBc 3aBc 3abC 1abc,2Cc =4AABbCc,1AA,1BB 2Bb 1bb,1CC2AaBBCC,1BB,共27種基因型,2Cc =4AaBBCc 1
30、cc =2AaBBcc 1CC =4AaBbCC,2Aa,2Bb,2Cc =8AaBbCc,1cc =4AaBbcc 1CC =2AabbCC,1bb,2Cc =4AabbCc 1cc =2Aabbcc,基因型比例: 1CC1AABBCC 2Cc =2AABBCc 1cc =1AABBcc 1CC =2AABbCC 1aa 1cc =2AABbcc 1CC =1AAbbCC 2Cc =2AAbbCc 1cc =1AAbbcc,1BB 2Bb 1bb,1CC1aaBBCC 2Cc =2aaBBCc 1cc =1aaBBcc 1CC =2aaBbCC 2Cc =4aaBbCc 1cc =2aaBb
31、cc 1CC =1aabbCC 2Cc =2aabbCc 1cc =1aabbcc,(3)、多對基因雜交后代比例的推算,例:AaBbCcDdEeFf,AaBbCcDdEeFf,(36=243),求F1基因型為AA bb Cc DD ee Ff的個體的概率,因為(AaAa),1AA:2Aa:1aa,所以AA1/4,Aa=1/2,aa=1/4,該基因型可用每對基因各別的概率相乘,即:,1/4(AA)1/4(bb)1/2(Cc)1/4(DD)1/4(ee)1/2(Ff)=1/1024,根據(jù)乘法定律推算的自由組合的不同基因?qū)?shù),雜交F1配子及配子組合,F(xiàn)2基因型和表現(xiàn)型,(4)、二項式(binomia
32、l equation)展開與遺傳咨詢,(這里主要涉及某種事件組合出現(xiàn)的概率),例:Aaaa雜交中,如果只產(chǎn)生兩個后代,則這兩個后代出,現(xiàn)Aa和aa的組合可能: ( 因為: Aaaa 1/2Aa ,1/2aa),第一后代,第二后代 概率,Aa (兩個后代全為Aa) Aa 1/21/2=1/4 Aa (一個為Aa,一個為aa) aa 1/21/2=1/4,aa,Aa 1/21/2=1/4,aa (兩個全為aa) aa 1/21/2=1/4,因為屬于獨立事情,故每個組合的概率可按乘法定律計算 若不計較次序的先后,它們概率的分布是 兩個后代都是Aa的概率為1/4 一個后代為Aa,一個后代為aa的概率為
33、1/41/4=2/4 兩個后代都是aa的概率為1/4,分布形式,1:2:1是二項式展開(p+q)2=1p2+2pq+1q2的系數(shù)。,如果設(shè)Aa=p,aa=q,則:(Aa)+(aa)2=1(Aa)(Aa)+2(Aa)(aa)+1(aa)(aa). 將每一個體的概率代入上式有:,(1/2)+(1/2)2=1(1/2)(1/2)+2(1/2)(1/2)+1(1/2)(1/2)=1/4+2/4+1/4,以上就是一個Aaaa交配產(chǎn)生兩個后代時,各種基因型組合的概率。,后代的每一特定組合的概率(后代個體分為兩類的任何比數(shù)),都可用這一組合,的二項式展開的系數(shù)在總共可能出現(xiàn)的組合數(shù)中的比率來表示。,例:Aa
34、aa的雜交有4個后代,問4個后代基因型都是Aa的概率,是多少? 這相當(dāng)于(p+q)4=1/16+4/16+6/16+4/16+1/16,展開式的第一項,即1/16,系數(shù)是1, 總共可能的組和數(shù)是16。,(pq)2 (pq)4 (pq)n,公式的二次方代表二個個體 4代表四個個體 n代表n個個體,一般來說,設(shè)p為某一基因型或表現(xiàn)型出現(xiàn)的概率,而q或,p1是另一個基因型或表現(xiàn)型的出現(xiàn)概率,則pq1,這樣這,一事件每一組合的概率就可用二項式展開來說明。,一般的二項式展開:,(p+q)n=pn+npn-1q+n!/i!(n-i)1pn-iqi+npqn-1+qn (1),公式中任何一項都可表示一種概率
35、,在n個個體中,出現(xiàn)i個個體的概率,,可用p(i,n)表示: p(i,n)=,(返回),= n(n-1)(n-2)1,!代表階乘,n! 就是n的階乘,n! O! =1,式(2)中,n,!,/i,!(n-i) !是二項式展開的系數(shù),在公式(2)中,n代表后代數(shù)目,i代表某一基因型(例如Aa)或表現(xiàn)型的后代數(shù)目 n-i代表另一基因型(例aa)或表現(xiàn)型的后代數(shù)目 p代表某一基因型或表現(xiàn)型出現(xiàn)的概率 q代表另一基因型或表現(xiàn)型出現(xiàn)的概率,pn-iqi (2),n! i!(n-i)!,例:求AaAa的雜交中四個后代個體中三個是 A,一個是a的組合的概率。 因為 AaAa,1/2A,1/2a,個體中,1/2
36、A 1/2a,1/4AA 1/4Aa,1/4Aa 1/4aa,A_的概率是3/4 aa的概率是1/4,按公式(2),(2.65),(4!/3!1!)(3/4)3(1/4)1=4321/3211 333/444 1/4=27/64 按(p+q)4=p4+4p3q+6p2q2+4pq3+q4 (2.64) 4p3q=4(3/4)3(1/4)=(3/4)3=27/64,4.1.1 適合度(吻合度、好適度)測驗 (goodness of fit) 遺傳學(xué)研究中 理論計算來預(yù)期雜交后代的基因型、表現(xiàn)型 理論預(yù)期的結(jié)果(相不相符)實際實驗的結(jié)果 判斷實得結(jié)果同理論預(yù)期的符合程度的問題,在統(tǒng)計學(xué)上叫做,“好
37、適度測驗”,(1)機率分布與波動的產(chǎn)生 實得結(jié)果與理論預(yù)期之間普遍存在著偏差 根本的原因是由于機率和隨機取樣而產(chǎn)生的波動,每一試驗中,取樣個體數(shù)目,有限樣本,理想群體,理論上應(yīng)該由無限的個體組成,隨機地抽取一部分個體作為樣本或代表理想群體中各種類型(例如黃豌 豆與綠豌豆,正常與白化人等等)的出現(xiàn)是由機率決定的,因此在取樣 時便可能取得各種不同比數(shù)的樣本,從而使實得結(jié)果與理論預(yù)期發(fā)生了 偏差 取樣誤差,或機率的波動,例:一個白化基因雜合體女子同雜合體男子結(jié)婚(AaAa),假定這對 夫婦一共生了四個孩子。試問是否一定是3個正常1個白化?如果不是這 樣的話,是否說明了孟德爾定律不對?,根據(jù)孟德爾定律
38、:每胎生正常小孩的概率: 生白化小孩的概率:,3/4 1/4,每胎各為獨立事件,(因為每次受精都是獨立發(fā)生的)根據(jù)二項式展開: (p+q)4=p4+4p3q+6p2q2+4pq3+q4 生四個孩子有以下五種不同的情況:,4個孩子都正常,其概率:,p4=(3/4)4=81/256,3個正常,1個白化,有4種組合,其概率: 4p3q=4(3/4)3(1/4)=108/256,2個正常,2個白化,6種可能,總概率: 1個正常,3個白化, 4種可能,總概率: 4個孩子都是白化,其概率:,6p2q2=6(3/4)2(1/4)2=54/256 4pq3=4(3/4)(1/4)3=12/256 q4=(1/
39、4)4=1/256,上述五種情況的總概率: 81/256+108/256+54/256+12/256+1/256=1 從以上可以看出,在 AaAa 生4個孩子時 并不一定是3(正常):1(白化) 其中完全符合預(yù)期比例的是第二種情況,而它的概率只有108/256,即 在256個家庭中約有108個家庭如此。其余四種情況都不符合預(yù)期比例, 但它們各有一定機率(概率),比例 4:0,概率 81/256,與理論比例的偏差愈大,則其機率也愈低,2:2 1:3 0:4,54/256 12/256 1/256,這四種不符合理論比例的情況的總概率為 81/256+54/256+12/256+1/256=148/
40、256,換句話說,在AaAa生4個孩子時,每256個家庭中大約108個家庭是完全 符合3:1的,有148個家庭是不符合3:1的,所以如果我們只考慮一個家 庭,就相當(dāng)大的機會(148/256)取到不符合3:1的家庭(樣本)。,例:設(shè)在AaAa的測交中共得20個子代。 試問得到15個顯性,5個隱性的機率是多少? 按照分離法則,測交后代的理論比為1:1,按二項式展開,特定組合公式有:,n=20, i=15, p=1/2, q=1/2,所以p20!/15!(20-15)! (1/2)5(1/2)15=0.015,即在每100次這樣的試驗中將有1.5次會得到15:5這樣的結(jié)果。,再問得到10個顯性和10
41、個隱性的機率是多少?,p=20!/10!10! (1/2)10(1/2)10=0.176,即大約在100次這樣的試驗中會有17.6次得到10:10的結(jié)果,在上,述雜交試驗中實際結(jié)果一共有21種可能。,所以在Aaaa產(chǎn)生20個子代時也不一定每次實驗都會得到1:1(即10:,10)的預(yù)期結(jié)果。而是有21種不同的可能結(jié)果。其中以得到完全符合預(yù) 期比例(10:10)的機率為最高:0.176。實得結(jié)果離開預(yù)期比例愈 遠,則其機率愈低。即在預(yù)期比例左右波動。這種現(xiàn)象叫做機率分布。 因此,在遺傳學(xué)試驗中實得結(jié)果與理論預(yù)期發(fā)生偏差是必然的不可 避免的。顯然,產(chǎn)生這種偏差的原因并非試驗過程有差錯,更不是孟德 爾
42、法則本身不正確,而是由于機率分布隨機取樣而產(chǎn)生的波動。,Aaaa 時20個子代中有K個為顯性時的機率p,(2)顯著水平,觀察值與預(yù)期值 偏差愈小,符合程度愈高,偏差太大,可能就不,符合,可能具有顯著的差異,1)、小概率事件不可能發(fā)生原理,共100個小球,黑球:白球1:99,問白球是否是99個?假設(shè)袋中 的白球是99個,任取一個球得到黑球的概率是1/100,即在一次取球中 很少遇到抽取一球是黑球的。,現(xiàn)居然從袋中抽到一黑球,那自然使人懷疑假設(shè)。,小概率原理:小概率事件在一次試驗中幾乎是不可能出現(xiàn)的。 若根據(jù)一定的假設(shè)條件計算出來該事件發(fā)生的概率很小,而在一次 試驗中競?cè)话l(fā)生了,則認為假設(shè)的條件不
43、正確。因此,否定假設(shè)。,零假設(shè):Ho,是否成立,一次試驗,如果小概率事件居然發(fā)生,則拒絕Ho,接受HA。,反之若小概率事件不發(fā)生,則接受Ho。,由以上原理建議起來的檢驗方法稱為顯著性檢驗。,2)、顯著水平的界限,究竟概率小到什么程度,才能當(dāng)作小概率事件?,統(tǒng)計學(xué)上有一個人為的界限:,當(dāng)p0.05差異不顯著 0.05p0.01差異顯著,p0.01差異非常顯著,如試驗屬于隨機誤差的概率小于5或1時,就可認為一次試驗,中,它不能屬于隨機誤差,而主要是試驗處理效應(yīng)。因此,否定Ho:1 2,接受HA:12,從而推斷理論值與實際值之間差異顯著或非,常顯著。當(dāng)試驗屬于隨機誤差的概率大于5,說明試驗結(jié)果符合,
44、Ho:1=2的可能性大。因此,接受Ho,否定HA。,所謂顯著水平,實際是一個小概率值,由于取定值,后,即確定了否定域,實測值落此區(qū)域內(nèi)時,就否定原,假設(shè),得出差異顯著的結(jié)論,故稱值為顯著性水平。,定義:X2(N) (O-E)2/E O:observed number,X2(n)=(實得數(shù)預(yù)期數(shù))2/預(yù)期數(shù) E:expected number,:the sum over all categories N:degree of freedom(自 x 由度) df n1 2、卡平方測驗的方法步驟 (1)建立假說(提出零假設(shè)H0和備擇假說HA) (2)算預(yù)期值;確定顯著水平 (3)計算X2值 (4)確
45、定自由度,查X2表,求偏差的概率,對假設(shè)進行選取。,4.1.2.用卡平方(chi-square)來測定適合度 1、卡平方的定義 X2是經(jīng)過統(tǒng)計學(xué)處理后計算出來的一個指數(shù), 用來代表實得數(shù)與理論預(yù)期數(shù)的總偏差。,例如,在番茄中某次實驗以純合的紫莖、缺刻葉植株( AACC)與純合的綠莖、馬鈴薯葉植株( aacc)雜交,F(xiàn)2 得 到454個植株,其4種表型的頻數(shù)分布如下:,紫莖缺刻葉,247,紫莖馬鈴薯葉 90,綠莖缺刻葉,83,綠莖馬鈴薯葉 34 判斷該實驗結(jié)果是否符合孟德爾的9: 3: 3: 1的理論比率?,解: 假設(shè),H0:樣本結(jié)果247:90:83:1,符合理論比率9:3:3:1 HA:不符
46、合9:3:3:1 顯著水平:0.05,理論預(yù)期,4549/16255.37 4543/1685.13 4541/1628.37,2=(247-255.4)2/255.4+(90-85.1)2/85.1,+(83-85.1)2/85.1+(34-28.4)2/28.4,= 1.17,查X 值表,df3 , X( 3)0.057.82, Xc 0.05,自由度 df=n-1413,2 2,2,(1.717.82),接受H0,即樣本結(jié)果是符合理論比率9:3:3:1 的,,或247:90:83:34可以合理地認為是247:90:83:34總體的一個 隨機樣本。,習(xí)題(1),1. 兩基因雜交F2具有四種表型,分別為88、 34、32、10,用卡平方法測定這一結(jié)果是 否與理論上預(yù)期的9:3:3:1的比例相符 合。,4.4,人類中的孟德爾遺傳分析,4.4.1 人類遺傳的系譜分析法 人類中不能進行控制性婚配,因此,人類中簡單的孟德 爾式遺傳分析主要依賴于系譜(pedigree)記錄,系譜分析 (pedigree analysis)是判斷人類單基因決定的孟德爾式 遺傳方式的經(jīng)典方法。 系譜圖: 是根據(jù)血緣關(guān)系繪制出來的一種家庭成員示意圖 利用該示意圖來圖解表明
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