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第五章蛋白質(zhì)的合成,轉(zhuǎn)運(yùn)和加工第一節(jié)氨基酰-tRNA的形成及核糖體的作用位點(diǎn)一.氨基酰tRNA分子的形成氨基酸的活化活化:
aa+ATP+E*氨基酰-AMP-E+PPi
轉(zhuǎn)移:氨基酰-AMP-E+tRNAaa-tRNA+AMP+E二.氨酰tRNA合成酶的鑒別功能動(dòng)力學(xué)校對(duì)(Kineticprofreading)化學(xué)校對(duì)(Chemicalproofreading)三核糖體的作用位點(diǎn)⑴A位點(diǎn)(或稱acceptorsite)可以進(jìn)入氨基酰-tRNA(aminoacyl-tRNA)。⑵P位點(diǎn)(或稱供位,donorsite)是被肽基酰-tRNA(peptidyl-tRNA)所占據(jù)。(3)E位點(diǎn)(Exitsite)脫酰tRNA(deacylated-tRNA)短暫地占據(jù)。第二節(jié)肽鏈的合成一.在細(xì)菌中翻譯的起始⑴IF-3是30S亞基與mRNA起始位點(diǎn)的特異結(jié)合所必須的。⑵IF-2是特異地和起始tRNA結(jié)合并把它帶到起始復(fù)合體中。⑶IF-1僅作為完整的起始復(fù)合物的一部分,與30S亞基結(jié)合。它結(jié)合在A位能阻止氨酰tRNA的進(jìn)入。它的定位還阻止30S和50S的結(jié)合。2.起始復(fù)合物的形成(1)IF-3和核糖體30SrRNA結(jié)合使16SRNA和mRNA的S-D順序結(jié)合a.使30S保持游離b.形成起始復(fù)合體I(2)IF-2+GTP+氨酰甲硫氨酸中間復(fù)合體。
(3)50S+30S復(fù)合體III,釋放IF-1,IF-2。原核生物翻譯起始因子二.起始tRNA的特點(diǎn)翻譯時(shí)的第一個(gè)密碼子是怎樣被識(shí)別的呢?(一)小亞基上16SrRNA3′端的六核苷酸(3′-UCCUCC-5′)和Shine-Dalgarno順序(5′-AAACAGGAGG-3′)互補(bǔ),相互結(jié)合,使下游的AUG起始密碼子定位在P位上。(二)核糖體結(jié)合位點(diǎn)也含有一個(gè)信號(hào)起始密碼子(initiationcodon)-AUG。起始和延伸Met-tRNAs的區(qū)別⑴兩種tRNA本身有差別;⑵氨基酸的狀態(tài)不同。fMet-tRNA與Met-tRNA有什么不同?⑴Met-tRNAmMet在受體臂末端的一對(duì)堿基是GC,在fMet-tRNAfMet是CA,C可以和起始因子IF-2結(jié)合。⑵tRNAfMet在反密碼子環(huán)的莖上有3對(duì)G-C,若發(fā)生突變將會(huì)阻止其進(jìn)入P位點(diǎn)。⑶tRNAfMet的反密碼子環(huán)上的是A,tRNAmMet是烷基化腺嘌呤。tRNAfMetTψC環(huán)端是A,tRNAmMet的相應(yīng)位置是G,作用不清。三真核生物蛋白質(zhì)合成的起始
四.起始時(shí)mRNA和rRNA的堿基配對(duì)(一)原核30S小亞基和S-D順序的結(jié)合在細(xì)菌中被核糖體保護(hù)的DNA區(qū)域長35-40堿基長。有2個(gè)共同的特點(diǎn):⑴含有起始密碼子AUG;⑵有一個(gè)順序和16SrRNA近3
端的順序互補(bǔ)。(二)真核合成起始時(shí)小亞基和
起始位點(diǎn)的結(jié)合真核細(xì)胞質(zhì)中的核糖體并不在編碼區(qū)開始處直接和起始位點(diǎn)相結(jié)合。首先識(shí)別5
端甲基化的帽子結(jié)構(gòu)。內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)(internalribosomeentrysite,IERS)A最適合的鄰接順序是GCCCCAUGGG稱為Kozak順序第二節(jié)肽鏈合成的延伸和終止一肽鏈合成的延伸肽鏈的
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