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文檔簡介
1、PubMed是圖書館秋冬季系列的第七次數(shù)據(jù)庫培訓(xùn),它介紹了如何使用數(shù)據(jù)庫以及如何處理檢索結(jié)果。從字面上看,PubMed這個名字來自英語單詞“Public”和“Medline”,意思是為公眾提供免費的醫(yī)學(xué)信息檢索服務(wù)。Pubmed是NLM國家醫(yī)學(xué)圖書館下屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)建立的生物醫(yī)學(xué)文獻檢索系統(tǒng),它使用NCBI的Entrez檢索平臺。它是搜索全世界生物醫(yī)學(xué)期刊的重要工具?;诨ヂ?lián)網(wǎng),它提供免費的檢索服務(wù),一些文件(約5%)可以免費下載全文。1.MEDLINE(Medline是PubMed的核心內(nèi)容)2。3號線前。出版商提供了引文。MEDLINE是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館開發(fā)的生物醫(yī)
2、學(xué)摘要光盤數(shù)據(jù)庫。它于1983年推出,已經(jīng)被廣泛使用了20多年。它包含自20世紀(jì)60年代以來在70多個國家和地區(qū)出版的5,300多種重要生物醫(yī)學(xué)期刊的書目和摘要(截至2006年10月的統(tǒng)計數(shù)據(jù)),涉及廣泛的生物醫(yī)學(xué)和相關(guān)學(xué)科(如農(nóng)業(yè)、化學(xué)等)。)。數(shù)據(jù)庫中大約80%的記錄提供摘要。Medline數(shù)據(jù)庫中的文獻主要是英文(約85%),但也包括世界上其他幾十種重要的語言。對于原始文本不是英語的文檔,當(dāng)包含Medline時,原始文檔的標(biāo)題信息被翻譯成英語并適當(dāng)標(biāo)記(非英語文檔的標(biāo)題用方括號括起來)。該記錄被標(biāo)記為“Medline PubMed索引”。Pre-MEDLINE是MEDLINE的預(yù)處理數(shù)據(jù)
3、庫,主要包含未被索引的書目信息,只提供基本的書目線索,如標(biāo)題、作者、摘要、來源等。醫(yī)學(xué)預(yù)科班屬于medline的最新內(nèi)容,檢索Medline光盤時找不到。只能在下一次更新Medline光盤后才能檢索。由于沒有主題索引,自由詞檢索記錄被用來標(biāo)記“PubMed-in process”?!俺霭嫔烫峁┑囊摹笔菙?shù)據(jù)庫的檢索界面,對于未包含在由出版商直接提供給PubMed的Medline中的電子期刊記錄,該界面標(biāo)記為“PubMed-由出版商提供”。PubMed有兩個獨立的互聯(lián)網(wǎng)域名。/sites/entrez/,NCBI,其他資源簡單搜索、輔助搜索、特
4、殊搜索、數(shù)據(jù)庫使用、簡單搜索、輔助搜索、特殊搜索、數(shù)據(jù)庫使用-簡單搜索,在pubmed初始搜索界面的唯一搜索框中輸入任意搜索詞或搜索公式,然后點擊“Go”按鈕,系統(tǒng)將顯示搜索結(jié)果。輸入的搜索詞不區(qū)分大小寫,可以是任何具有實際意義的詞或短語,如自由詞(疾病名稱、藥物名稱)、主題詞、人名、地名、期刊名稱、期刊ISSN號等。搜索公式是指通過使用布爾邏輯運算符和分詞字符(通配符)來組合搜索詞。PubMed可以使用布爾邏輯運算符“與”、“或”和“非”。具有多個布爾邏輯運算符的搜索表達(dá)式是按照從左到右的自然順序進行操作的,并且沒有運算符的偏好,但是可以使用半角括號來指定搜索表達(dá)式的優(yōu)先操作順序,例如“輔助
5、和(中國或韓國)”。布爾邏輯運算符必須大寫才有效。支持“*”截斷運算符,用于匹配多個字符。Entrez PubMed具有自動術(shù)語映射功能。通過該功能,系統(tǒng)將在搜索框中依次搜索用戶輸入的不合格搜索詞,如MeSH詞轉(zhuǎn)換表、期刊翻譯表、短語列表和作者索引。作者搜索格式:姓氏首字母的全名(最多兩個字母)搜索2006年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎獲得者安德魯茲費爾發(fā)表的論文,可以直接在搜索框中輸入“火a”或“火az”。例如:檢索鐘南山院士發(fā)表的論文,輸入“鐘NS”或“鐘N”,期刊檢索:標(biāo)題檢索或序號檢索:全稱或簡稱序號檢索:ISSN(國際標(biāo)準(zhǔn)序號)注:我國PubMed發(fā)表的期刊名稱均為中文拼音,不含英文翻譯。輸入檢索詞
6、后,PubMed的自動詞匹配功能將優(yōu)先將這些詞轉(zhuǎn)換成醫(yī)學(xué)主題詞(同時作為自由詞)進行檢索,而不是自動檢索期刊和作者姓名。搜索作者姓名時,很容易檢索到姓名格式相同但實際上不同的其他作者。對策使用受限字段檢索,格式:搜索項的字段名稱,例如,鐘nsau使用半角雙引號調(diào)出搜索項,迫使PubMed進行精確的短語檢索。例如,如果您在搜索框中輸入“基因治療”,系統(tǒng)將直接在數(shù)據(jù)庫的所有字段中搜索該短語,而不是執(zhí)行自動單詞匹配功能。使用布爾邏輯運算符添加約束。例如,搜索廣州醫(yī)學(xué)院鐘南山的論文:鐘nsau和廣州med*ad、數(shù)據(jù)庫字段、常用字段:ad(作者)、au(作者)、TI(標(biāo)題)、LA(語言)、MH(主題)
7、、PT(文檔類型)、(標(biāo)題/)國家或地區(qū))、RN(酶代碼和化學(xué)文摘登記號)、TA(期刊名稱)以及數(shù)據(jù)庫輔助檢索的使用方法,限制預(yù)覽/索引歷史剪貼板細(xì)節(jié),限制、限制和修改搜索項或搜索策略以縮小搜索范圍,獲得更準(zhǔn)確的搜索結(jié)果并改進一旦“限制”被設(shè)置或修改,它將對后續(xù)搜索保持有效,直到它被再次設(shè)置。作者搜索(按作者搜索,可輸入多個作者姓名)、期刊搜索(按期刊搜索,可輸入多個期刊名稱)、僅全文、自由全文和摘要;日期(出版日期和加入PubMed數(shù)據(jù)庫的日期);受試者(湖南人或動物);性別(性別);語言);文件;子集。和:物品類型;受試者的年齡組;指定標(biāo)簽術(shù)語。預(yù)覽/索引、預(yù)覽/索引包括預(yù)覽和索引功能。預(yù)
8、覽預(yù)覽最后三個搜索的結(jié)果,對每個搜索進行編號(#加數(shù)字),列出搜索公式、搜索時間和命中文檔的數(shù)量。用戶可以根據(jù)命中文檔的數(shù)量來判斷是否需要進一步修改搜索公式來縮小或擴大搜索范圍,從而避免每次傳輸大量數(shù)據(jù)而浪費時間。在此欄中,您可以直接進行新的匹配。用鼠標(biāo)單擊預(yù)覽中的索引號鏈接,將出現(xiàn)一個“選項”菜單,供用戶執(zhí)行相關(guān)操作,如邏輯組合(與、或、否)、刪除、搜索(執(zhí)行)、查看搜索詳細(xì)信息、保存在我的NCBI等。用鼠標(biāo)單擊命中記錄的數(shù)量,查看檢索到的文檔。索引是從索引中查看和選擇關(guān)鍵字。例如,要搜索與結(jié)核病相關(guān)的網(wǎng)格詞,請在輸入框中輸入結(jié)核病,在前面的下拉菜單中選擇網(wǎng)格術(shù)語,然后單擊索引按鈕。所有與結(jié)
9、核病和點擊記錄相關(guān)的關(guān)鍵詞將顯示在以下滾動索引窗口中。選擇“結(jié)核病/藥物治療(19012)”并點擊“與”、“或”或“否”按鈕,結(jié)核病/藥物治療網(wǎng)格術(shù)語將自動出現(xiàn)在檢索問題框中。歷史記錄、歷史記錄的功能與預(yù)覽類似,但歷史記錄可以保存用戶的所有檢索請求和結(jié)果。該窗口顯示檢索序列號、檢索公式、檢索時間和命中文檔數(shù)。單擊“清除歷史記錄”按鈕清除所有檢索歷史記錄。用鼠標(biāo)點擊歷史中的檢索類型號,還會出現(xiàn)一個“選項”菜單,供用戶邏輯組合(與或否)、刪除、搜索(執(zhí)行)、查看檢索詳細(xì)信息、保存在我的NCBI等。點擊熱門文獻編號,查看檢索到的文獻。搜索記錄在系統(tǒng)中保存8小時。剪貼板,剪貼板主要用于臨時存儲一個或多
10、個檢索結(jié)果中的選定記錄(“發(fā)送到剪貼板”包含在PubMed檢索結(jié)果處理方法中)。用戶可以對剪貼板中的文檔進行排序和發(fā)送,也可以對剪貼板中的文檔進行進一步的搜索:例如,要查找剪貼板中的英文文檔,可以在搜索框中輸入“#0和英文LA”,這不會影響剪貼板中的內(nèi)容。#0表示剪貼板中的現(xiàn)有文檔。剪貼板可以容納多達(dá)500個文檔;如果PubMed停止8小時或更長時間,剪貼板的內(nèi)容將被清除;詳細(xì)信息、詳細(xì)信息的功能主要用于查看和編輯每次檢索,并可以添加或刪除搜索詞。例如,在簡單搜索框中輸入搜索詞“肝癌肝炎”并搜索,您可以在詳細(xì)信息中看到相應(yīng)的轉(zhuǎn)換過程?!安樵兎g”項列出了該搜索詞的自動匹配;用戶可以修改該檢索公
11、式,并點擊“搜索”按鈕再次檢索。點擊“網(wǎng)址”按鈕,進入顯示本次搜索結(jié)果的頁面,使用瀏覽器的書簽(或收藏夾)菜單,將當(dāng)前搜索項以書簽的形式保存為網(wǎng)址,以便下次再次搜索;“結(jié)果”項表示該搜索中命中文檔的數(shù)量;“翻譯”項描述了用戶輸入的每個搜索詞的轉(zhuǎn)換;數(shù)據(jù)庫描述了這次檢索的數(shù)據(jù)庫對象;“用戶查詢”列出了用戶在該搜索中輸入的搜索詞。特殊搜索、期刊數(shù)據(jù)庫、MeSH數(shù)據(jù)庫、單次引用匹配器、臨床查詢、期刊數(shù)據(jù)庫、PubMed期刊的查詢相關(guān)信息:您可以在期刊名稱(全名或縮寫)、ISSN號和期刊名稱中輸入任意一個或多個詞來查找期刊的詳細(xì)信息。包括標(biāo)題、ISSN編號、標(biāo)題縮寫、國際標(biāo)準(zhǔn)化組織縮寫、出版起始年份、
12、出版商、延續(xù)注釋、語言、出版國家、主題術(shù)語、NLM標(biāo)識等。并選擇“發(fā)送到搜索框或”命令來搜索在此期刊上發(fā)表的文獻。MeSH數(shù)據(jù)庫,供用戶查詢醫(yī)學(xué)主題詞并構(gòu)建相關(guān)檢索策略:輸入自由詞,系統(tǒng)將提供相似主題詞供用戶選擇。例如,點擊“MeSH Database”,界面將進入關(guān)鍵字檢索狀態(tài)。在搜索框中輸入“艾滋病”,系統(tǒng)會在頁面中列出相關(guān)的醫(yī)學(xué)關(guān)鍵詞,并逐一進行簡要評論。點擊其中一個關(guān)鍵字,系統(tǒng)將顯示該關(guān)鍵字的詳細(xì)信息。包括:詞義標(biāo)注包含在醫(yī)學(xué)主題詞表中的年數(shù),所有可以與主題短語表匹配的子主題詞(可以檢查),主題詞的樹形結(jié)構(gòu)表是否將主題詞限定為主主題詞(僅限于對主主題標(biāo)題的搜索),是否進行擴展搜索(不要
13、分解該術(shù)語),輸入“輔助”進行搜索, 系統(tǒng)列出相關(guān)關(guān)鍵詞:點擊所需關(guān)鍵詞,輸入關(guān)鍵詞的詳細(xì)信息,選擇子關(guān)鍵詞“飲食療法”、語義標(biāo)注、收錄時間、搭配子關(guān)鍵詞(允許多選)、是否僅限于主關(guān)鍵詞、是否擴展。,獲得搜索結(jié)果,使用搜索公式,雖然通過主題詞數(shù)據(jù)庫搜索主題詞很麻煩,但其搜索結(jié)果準(zhǔn)確度高且不易遺漏,因此可以說是最好的搜索方法之一。一旦掌握了,就能事半功倍。單次引用匹配器(Single引文匹配器),單次引用匹配器可以通過輸入論文的相關(guān)信息,如論文名稱、卷、期、頁碼、出版日期、作者和論文標(biāo)題的關(guān)鍵詞,快速檢索論文。例如,我們知道一位名叫哈欽斯的作者在1979年發(fā)表了一篇論文。這篇論文在雜志上的最初頁碼是745,但我們不知道這份文件的其他相關(guān)信息。我們可以通過單引用匹配器(未知為空)輸入有限的已知信息,快速找到這篇論文。單次引用匹配器的功能也可以通過上述PubMed有限域搜索來實現(xiàn)。在上例中,您可以在搜索框中輸入搜索公式“HutchinsA
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