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第三章基因工程設(shè)計策略及操作流程演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有97頁\編輯于星期五優(yōu)選第三章基因工程設(shè)計策略及操作流程現(xiàn)在是2頁\一共有97頁\編輯于星期五3.4.1基因的體外連接重組含目的基因的外源DNA在體外通過限制性內(nèi)切酶和DNA連接酶的作用與載體連接,獲得重組DNA的過程,稱為基因的體外連接重組?;虻捏w外重組有兩種方式:插入式和置換式。現(xiàn)在是3頁\一共有97頁\編輯于星期五基因體外重組的類型現(xiàn)在是4頁\一共有97頁\編輯于星期五插入式是用一種限制性內(nèi)切酶消化載體,在載體上此酶只有一個識別序列,實現(xiàn)外源片段插入載體的切口;置換式可用兩種限制性內(nèi)切酶或是在載體上有兩個識別序列的一種限制性內(nèi)切酶處理載體,載體被切成大小不等的兩個片段,把外源DNA與載體大片段連接,即置換了載體中原有的小片段,形成重組DNA分子。現(xiàn)在是5頁\一共有97頁\編輯于星期五形成重組DNA的實質(zhì)就是催化外源DNA與載體DNA間高效地形成3′,5′-磷酸二酯鍵,連接方式有很多種,具體使用時要根據(jù)外源DNA與載體DNA末端的性質(zhì)選擇合適的方法,以保證連接效率。現(xiàn)在是6頁\一共有97頁\編輯于星期五DNA連接酶現(xiàn)在是7頁\一共有97頁\編輯于星期五(1)互補黏性末端的連接互補黏性末端的產(chǎn)生是由于外源DNA和載體DNA用同一種限制性內(nèi)切酶切割或是用兩種同尾酶切割,但用同尾酶切割后產(chǎn)生的重組DNA分子喪失了原有的兩種限制性內(nèi)切酶的識別序列?,F(xiàn)在是8頁\一共有97頁\編輯于星期五黏性末端的連接現(xiàn)在是9頁\一共有97頁\編輯于星期五A兩段DNA的連接依靠粘性末端現(xiàn)在是10頁\一共有97頁\編輯于星期五BDNA片斷與載體的連接依靠粘性末端現(xiàn)在是11頁\一共有97頁\編輯于星期五現(xiàn)在是12頁\一共有97頁\編輯于星期五ligasenick現(xiàn)在是13頁\一共有97頁\編輯于星期五C
載體與載體的連接現(xiàn)在是14頁\一共有97頁\編輯于星期五20μL的互補黏性末端連接反應(yīng)體系為:2μLT4DNA連接酶緩沖液或E.coliDNA連接酶緩沖液5μL外源DNA片段5μL載體DNA片段1μLT4DNA連接酶或E.coliDNA連接酶其它用ddH2O補齊充分混勻后,16℃過夜連接連接體系現(xiàn)在是15頁\一共有97頁\編輯于星期五連接效率的檢測可用瓊脂糖凝膠電泳法,以載體酶切片段、外源DNA酶切片段為對照,若只出現(xiàn)兩條與對照帶相同的條帶,表明連接反應(yīng)失?。蝗舫霈F(xiàn)一系列新帶,表明發(fā)生連接。為了保證連接效率,減少連接過程中的副產(chǎn)物,連接時要注意以下幾點:接反應(yīng)中外源DNA片段和載體DNA片段的濃度、防止載體自身環(huán)化、產(chǎn)生兩種重組DNA分子?,F(xiàn)在是16頁\一共有97頁\編輯于星期五載體去磷酸化現(xiàn)在是17頁\一共有97頁\編輯于星期五雙酶切法現(xiàn)在是18頁\一共有97頁\編輯于星期五5’端與3’端并列靠近的時間太短,不容易被連接酶連接。T4DNA連接酶雖然能連接平末端,但效率很低,只有粘性末端的1%。5’5’5’5’3’3’3’3’-OH-OH-P-PP-P-HO-HO-5’3’-OH-PP-HO-5’3’(2)平末端的連接現(xiàn)在是19頁\一共有97頁\編輯于星期五如果把由兩種不同限制性內(nèi)切酶切割產(chǎn)生的平末端DNA片段進行連接,得到的連接產(chǎn)物就喪失了原有的識別序列。如果將由同一種限制性內(nèi)切酶產(chǎn)生的平末端DNA片段進行連接,得到的連接產(chǎn)物仍保留原有的識別序列或是出現(xiàn)一個新的識別序列?,F(xiàn)在是20頁\一共有97頁\編輯于星期五平末端片段的連接現(xiàn)在是21頁\一共有97頁\編輯于星期五(3)末端修飾后的連接①片段末端同聚物加尾法:一個為平末端和一個為黏性末端的DNA片段之間的連接,也可以兩個平末端DNA片段間的連接。需要末端轉(zhuǎn)移酶(terminaltransforase)催化,在酶的作用下按照5′→3′方向?qū)⑺姆N脫氧核苷酸分子的任意一種依次添加到DNA片段的3′-OH末端,形成同聚物poly(dC)或poly(dG)或poly(dT)或poly(dA)。現(xiàn)在是22頁\一共有97頁\編輯于星期五待連接的DNA片段末端加上長度約10-40個核苷酸的互補的同聚物尾巴后,在T4DNA連接酶的作用下形成重組DNA分子,重組DNA分子中有缺口的部分可待其轉(zhuǎn)入受體細胞后,利用受體細胞中的DNA聚合酶和DNA連接酶將缺口填補起來?,F(xiàn)在是23頁\一共有97頁\編輯于星期五片段末端同聚物加尾法能把任何片段連接起來不能把插入片段再切下來現(xiàn)在是24頁\一共有97頁\編輯于星期五②黏性末端修飾為平末端適用于兩個DNA片段末端為非互補黏性末端的情況,也可用于一個片段為平末端另一片段為黏性末端的情況。將黏性末端改為平末端需要在核酸外切酶Ⅶ(exonucleaseⅦ,ExoⅦ)的作用下,將雙鏈DNA片段的5′或3′端突出部分的單鏈斷裂,使黏性末端的DNA片段變?yōu)槠侥┒恕,F(xiàn)在是25頁\一共有97頁\編輯于星期五黏性末端修飾為平末端現(xiàn)在是26頁\一共有97頁\編輯于星期五(4)末端加連桿的連接連桿又叫銜接物(linker),是指用化學(xué)法合成的由10-12個核苷酸組成,具有一個或數(shù)個限制性酶識別位點的寡核苷酸片段。將連桿加在待連接的DNA分子的末端,然后用在連桿中具有識別位點的限制性內(nèi)切酶處理,即可得到具有互補黏性末端的兩種DNA片段,再在DNA連接酶作用下實現(xiàn)連接。GGAATTCCCCTTAAGGEcoRIlinker:現(xiàn)在是27頁\一共有97頁\編輯于星期五這種方法適合于具有平末端的兩種DNA片段,或是具有平末端和黏性末端的兩種DNA片段,也適用于非互補黏性末端的兩種DNA片段的連接?,F(xiàn)在是28頁\一共有97頁\編輯于星期五末端加連桿現(xiàn)在是29頁\一共有97頁\編輯于星期五現(xiàn)在是30頁\一共有97頁\編輯于星期五1978年康內(nèi)爾大學(xué)的吳瑞教授發(fā)明。5‘p-GATCCCGG-OH3’
GGCC-p5’
BamHIadapter用T4DNA連接酶連到DNA分子的兩端,直接成為人工粘性末端。①adapter一頭平末端、另一頭粘性末端(某種酶切位點序列)。②adapter的作用(5)DNA接頭(adapter)連接法現(xiàn)在是31頁\一共有97頁\編輯于星期五Blunt-endedDNA5’p-GATCCCGG-OH3’
HO-GGCC-p5’BamHIadapterP--P5‘p-GATCCCGG-
GGCC--CCGG
-GGCCCTAG-P5’
5‘p-GATCCCGG-
GGCC-CCGG
GGCCCTAG-P5’
CCGGGATCCCGG-OH
GGCCCTAGGGCC-P5’
接頭自我連接現(xiàn)在是32頁\一共有97頁\編輯于星期五現(xiàn)在是33頁\一共有97頁\編輯于星期五3.4.2重組分子的轉(zhuǎn)移重組分子構(gòu)建完成后,必須導(dǎo)入到合適的受體細胞,才能實現(xiàn)復(fù)制、擴增和表達。受體細胞又稱為宿主細胞,是指能夠攝取外源DNA并使其穩(wěn)定維持的細胞?,F(xiàn)在是34頁\一共有97頁\編輯于星期五將重組分子導(dǎo)入受體細胞的方法有很多種,如轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)染、顯微注射和電穿孔等多種方式,在轉(zhuǎn)移重組分子時根據(jù)受體細胞的區(qū)別選擇合適的導(dǎo)入方法。一般原核細胞和低等真核細胞作受體時主要用轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)染法,而高等動植物的真核細胞作受體時主要用顯微注射和電穿孔法?,F(xiàn)在是35頁\一共有97頁\編輯于星期五感受態(tài)制備過程培養(yǎng)大腸桿菌OD600至Onice5-10min4℃離心收集菌用冰冷的0.1mMCaCl2重懸4℃離心收集菌4℃離心收集菌分裝、-70℃凍存用冰冷的0.1mMCaCl2重懸Onice30min用冰冷的0.1mMCaCl2重懸現(xiàn)在是36頁\一共有97頁\編輯于星期五(1)重組分子轉(zhuǎn)入原核細胞
熱激法轉(zhuǎn)化(Ca2+有助于轉(zhuǎn)化)往感受態(tài)細胞中加入重組DNA分子置冰浴中培養(yǎng)30min后42℃熱休克90s實現(xiàn)感受態(tài)細胞對重組DNA分子的吸收?,F(xiàn)在是37頁\一共有97頁\編輯于星期五(2)重組分子轉(zhuǎn)入真核細胞酵母作為受體細胞的轉(zhuǎn)化與細菌類似,先去除細胞壁游離出原生質(zhì)球,接著在有CaCl2和聚乙二醇的溶液中,重組DNA很容易被受體細胞吸收。現(xiàn)在是38頁\一共有97頁\編輯于星期五哺乳動物細胞作為受體細胞可用磷酸鈣沉淀法、病毒顆粒轉(zhuǎn)染法、DEAE-葡聚糖轉(zhuǎn)染法、電穿孔法和顯微注射法等將外源基因?qū)搿M庠椿驅(qū)胫参锛毎€可利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的Ti質(zhì)粒載體轉(zhuǎn)化法。現(xiàn)在是39頁\一共有97頁\編輯于星期五作業(yè) 1.如何將兩端平齊末端的DNA進行連接?都有哪些可能的方法?2.如何保證克隆在載體上的目的基因片段的方向性?3.試比較轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)染。4.受體細胞應(yīng)滿足的條件有哪些?5.請寫出真核生物電穿孔、顯微注射、農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法的全過程。現(xiàn)在是40頁\一共有97頁\編輯于星期五3.5重組體的篩選3.5.1遺傳表型篩選法遺傳表型篩選法是比較直接的篩選方法,是根據(jù)轉(zhuǎn)化子接受了重組DNA而與非轉(zhuǎn)化子在表型上存在差異進行區(qū)分的一種方法。主要包括抗藥性篩選、插入失活篩選和顯色互補篩選?,F(xiàn)在是41頁\一共有97頁\編輯于星期五(1)載體表現(xiàn)特征篩選抗藥性篩選利用載體DNA分子上攜帶的抗藥性基因進行篩選。抗藥性基因主要有氨芐抗性基因(ampr)、氯霉素抗性基因(cmpr)、卡那霉素抗性基因(kanr)、四環(huán)素抗性基因(tetr)、鏈霉素抗性基因(smr)等?,F(xiàn)在是42頁\一共有97頁\編輯于星期五插入失活篩選法可彌補抗藥性篩選的不足,可直接篩選出含重組質(zhì)粒的受體細胞。這種方法利用質(zhì)粒載體的雙抗藥性?,F(xiàn)在是43頁\一共有97頁\編輯于星期五插入失活篩選現(xiàn)在是44頁\一共有97頁\編輯于星期五-半乳糖苷酶
乳糖半乳糖葡萄糖X-gal半乳糖5-溴-4-氯靛藍++深藍色1.原理:載體上有一段-半乳糖苷酶基因(LacZ)的片段(氨基端),其上有外源DNA的插入位點。受體菌基因組中有突變的-半乳糖苷酶基因(片段缺失)。可以被IPTG誘導(dǎo)表達。載體和受體菌基因組可以互補形成完整有功能的-半乳糖苷酶。藍白班篩選現(xiàn)在是45頁\一共有97頁\編輯于星期五互補而產(chǎn)生的lacZ+細菌在誘導(dǎo)劑IPTG(異丙基-β-D-硫代半乳糖苷)的作用下,在生色底物X-Gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)存在時產(chǎn)生藍色沉淀物,使菌落顯藍色。如果外源DNA插入到質(zhì)粒的多克隆位點后,無法實現(xiàn)互補,使得帶有重組質(zhì)粒的細菌形成白色菌落?,F(xiàn)在是46頁\一共有97頁\編輯于星期五-半乳糖苷酶使X-gal分解成藍色產(chǎn)物?,F(xiàn)在是47頁\一共有97頁\編輯于星期五藍白斑篩選現(xiàn)在是48頁\一共有97頁\編輯于星期五(2)插入序列表現(xiàn)特性篩選如果重組DNA分子中的插入序列在受體細胞中能夠?qū)崿F(xiàn)功能性表達,則可賦予受體細胞表現(xiàn)出插入序列編碼的表型特征,可利用此特點篩選含有重組子的轉(zhuǎn)化細胞。現(xiàn)在是49頁\一共有97頁\編輯于星期五從轉(zhuǎn)化后的菌體克隆中分離質(zhì)粒,電泳、比較其分子量。分子量Marker載體重組克隆3.5.2結(jié)構(gòu)特征篩選法(1)凝膠電泳篩選凝膠電泳篩選法是利用了重組質(zhì)粒和非重組質(zhì)粒在分子大小上存在差異的性質(zhì)。將平板上長出的菌落進行質(zhì)粒提取,然后進行瓊脂糖凝膠電泳?,F(xiàn)在是50頁\一共有97頁\編輯于星期五(2)菌落PCR篩選菌落PCR篩選是利用質(zhì)粒上的引物對質(zhì)粒DNA進行PCR擴增來鑒定重組子菌落。在多數(shù)載體DNA分子中,外源DNA插入位點兩側(cè)的序列是已知的。如果受體細胞中含有的是重組質(zhì)粒,以插入位點兩側(cè)序列的互補序列為引物進行PCR反應(yīng),則可獲得外源DNA。接著進行瓊脂糖凝膠電泳在外源DNA的位置就應(yīng)該有對應(yīng)的條帶。現(xiàn)在是51頁\一共有97頁\編輯于星期五如果受體細胞中是非重組質(zhì)粒,以插入位點兩側(cè)序列的互補序列為引物進行PCR,則在瓊脂糖凝膠電泳檢測時無法獲得與外源DNA相符的條帶?,F(xiàn)在是52頁\一共有97頁\編輯于星期五(3)酶切鑒定
酶切鑒定是利用重組質(zhì)粒中外源DNA可選用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切酶再回收的原理。將平板上長出的菌落增殖培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,對提取的質(zhì)粒分子進行酶切反應(yīng),接著用瓊脂糖凝膠電泳?,F(xiàn)在是53頁\一共有97頁\編輯于星期五重組質(zhì)粒會得到兩條帶,一條是與線性載體大小一致,另一條帶與插入的外源DNA大小一致,但非重組質(zhì)粒僅有一條帶,其位置與線性載體一致?,F(xiàn)在是54頁\一共有97頁\編輯于星期五ABA或B現(xiàn)在是55頁\一共有97頁\編輯于星期五現(xiàn)在是56頁\一共有97頁\編輯于星期五不同克隆的酶切結(jié)果現(xiàn)在是57頁\一共有97頁\編輯于星期五3.5.3核酸分子雜交篩選法核酸分子雜交法是利用特異的核酸探針與待測核酸進行雜交,檢測待測核酸中是否存在與探針互補的DNA片段。此法也可用于鑒別期望重組子和非期望重組子。在雜交前先將待測核酸變性,將其固定在硝酸纖維素膜上或尼龍膜上?,F(xiàn)在是58頁\一共有97頁\編輯于星期五然后用探針與之孵育,洗去多余的探針,若最終有顯示的條帶則證明含有目的基因,反之則無。核酸分子雜交法根據(jù)待測核酸來源和固相支持物的不同可分為Southern雜交法、Northern雜交法、斑點印跡雜交法和菌落印跡原位雜交法。現(xiàn)在是59頁\一共有97頁\編輯于星期五現(xiàn)在是60頁\一共有97頁\編輯于星期五Southernblot篩選結(jié)果現(xiàn)在是61頁\一共有97頁\編輯于星期五Southern雜交是將待測DNA分子酶切后變性,轉(zhuǎn)移至適當(dāng)?shù)臑V膜上用已標(biāo)記的單鏈DNA或RNA探針雜交以檢測這些被轉(zhuǎn)移的DNA片段。Northern雜交是將RNA分子變性及電泳分離后再用探針進行檢測?,F(xiàn)在是62頁\一共有97頁\編輯于星期五斑點印跡雜交是將變性的DNA或RNA核酸樣品直接轉(zhuǎn)移到適當(dāng)?shù)碾s交膜上,然后加探針進行雜交以檢測核酸樣品中是否存在特異的DNA片段或RNA片段。菌落原位雜交是直接把菌落或噬菌斑印跡轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素濾膜上,經(jīng)溶菌和變性處理后使DNA暴露出來并與濾膜原位結(jié)合,再用特異性DNA或RNA探針雜交,篩選出含有目的基因的菌落或噬菌斑。現(xiàn)在是63頁\一共有97頁\編輯于星期五現(xiàn)在是64頁\一共有97頁\編輯于星期五3.5.4免疫化學(xué)篩選法免疫化學(xué)篩選法是用抗體作為探針,而非DNA或RNA探針來鑒定目的基因的表達產(chǎn)物。免疫化學(xué)篩選法分為放射性抗體篩選、非放射性抗體篩選法和免疫沉淀篩選法?,F(xiàn)在是65頁\一共有97頁\編輯于星期五(1)放射性抗體篩選在放射性抗體篩選法中,先將待檢測的菌落或噬菌體按原位印跡到硝酸纖維素膜上,裂解細胞使目的蛋白抗原釋放并結(jié)合在膜上,然后與第一抗體反應(yīng)生成抗原-抗體復(fù)合物。現(xiàn)在是66頁\一共有97頁\編輯于星期五接著再用放射性125I標(biāo)記了的第二抗體(抗第一抗體中特異性抗原決定簇的抗體)直接檢測,去除過剩的第二抗體,薄膜干燥后放射性自顯影,即可顯示出是否有所需的重組體。現(xiàn)在是67頁\一共有97頁\編輯于星期五放射性抗體檢測法過程現(xiàn)在是68頁\一共有97頁\編輯于星期五(2)非放射性抗體篩選由于放射性物質(zhì)的半衰期短和安全問題,研究人員開發(fā)出了非放射性標(biāo)記物。如第二抗體可用辣根過氧化酶或堿性磷酸酶相偶聯(lián),檢測目的蛋白抗原-抗體復(fù)合物,或者也可用于辣根過氧化酶偶聯(lián)的抗生物素蛋白來檢測與生物偶聯(lián)的第二抗體等?,F(xiàn)在是69頁\一共有97頁\編輯于星期五待測基因產(chǎn)物蛋白一抗二抗酶
待測基因產(chǎn)物蛋白一抗二抗無色的底物有色的產(chǎn)物比色觀察酶
現(xiàn)在是70頁\一共有97頁\編輯于星期五(3)免疫沉淀篩選免疫沉淀篩選法是把與目的基因產(chǎn)物相對應(yīng)的標(biāo)記抗體加在有轉(zhuǎn)化子菌落的培養(yǎng)基中。利用抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的原理,如果在菌落周圍有白色圓圈,說明發(fā)生了抗體-抗原反應(yīng),表明該菌落產(chǎn)生與抗體相對應(yīng)的抗原蛋白(目的基因產(chǎn)物)。現(xiàn)在是71頁\一共有97頁\編輯于星期五對于不能被分泌到菌體外的蛋白質(zhì)可先進行原位溶菌處理(溶菌酶、原噬菌體誘發(fā))。現(xiàn)在是72頁\一共有97頁\編輯于星期五3.5.5轉(zhuǎn)譯篩選法利用克隆的DNA同所編碼的蛋白質(zhì)產(chǎn)物之間的對應(yīng)關(guān)系進行篩選,分為雜交抑制轉(zhuǎn)譯篩選和雜交選擇轉(zhuǎn)譯篩選?,F(xiàn)在是73頁\一共有97頁\編輯于星期五作業(yè) 1.舉例說明插入失活的基本原理。2.何謂ɑ-互補?何謂安慰性誘導(dǎo)物?3.如何用PCR來檢測目的基因是否被克?。克腔谑裁丛??現(xiàn)在是74頁\一共有97頁\編輯于星期五3.6克隆基因的表達3.6.1克隆基因的表達系統(tǒng)基因工程的表達系統(tǒng)分為原核和真核兩類,常用的原核細胞表達系統(tǒng)有大腸桿菌、枯草芽孢桿菌和鏈霉菌等,真核表達系統(tǒng)有酵母、絲狀真菌、昆蟲細胞和哺乳類細胞?,F(xiàn)在是75頁\一共有97頁\編輯于星期五原核生物作表達系統(tǒng)具有生長迅速、培養(yǎng)條件簡單等優(yōu)點,但大多缺乏轉(zhuǎn)錄后加工和對蛋白質(zhì)進行糖基化、磷酸化等修飾的能力。真核細胞作宿主表達系統(tǒng)雖能去除外源基因中的內(nèi)含子,并可對蛋白質(zhì)進行翻譯后加工,但其選擇標(biāo)記少、轉(zhuǎn)化效率低。現(xiàn)在是76頁\一共有97頁\編輯于星期五克隆基因的表達:外源基因在宿主細胞中表達外源基因表達載體重組載體導(dǎo)入宿主細胞在宿主細胞中表達出蛋白提取蛋白宿主細胞:原核細胞或真核細胞?,F(xiàn)在是77頁\一共有97頁\編輯于星期五3.6.2克隆基因在轉(zhuǎn)錄水平的表達與調(diào)控轉(zhuǎn)錄是基因表達的第一步,也是基因表達調(diào)控的主要層次?;蛟谵D(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控主要在轉(zhuǎn)錄的起始階段和終止階段,調(diào)控方式有順式作用和反式作用兩類,每一類中又有正調(diào)控和負調(diào)控兩種形式?,F(xiàn)在是78頁\一共有97頁\編輯于星期五順式調(diào)控是一段非編碼DNA序列對基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控作用,反式調(diào)控是一種蛋白質(zhì)作用于某一順式作用元件來影響基因的轉(zhuǎn)錄。正調(diào)控促進轉(zhuǎn)錄的進行,而負調(diào)控是抑制轉(zhuǎn)錄的發(fā)生。現(xiàn)在是79頁\一共有97頁\編輯于星期五(1)原核的轉(zhuǎn)錄起始與轉(zhuǎn)錄終止RNA聚合酶與啟動子的直接結(jié)合;強啟動子如Lac、Trp?,F(xiàn)在是80頁\一共有97頁\編輯于星期五現(xiàn)在是81頁\一共有97頁\編輯于星期五轉(zhuǎn)錄終止有兩種類型一種是不依賴于ρ因子的終止另一種終止機制是依賴于ρ因子的終止現(xiàn)在是82頁\一共有97頁\編輯于星期五(2)真核的轉(zhuǎn)錄起始與轉(zhuǎn)錄終止真核生物的啟動子由核心啟動子元件和上游啟動子元件兩部分構(gòu)成。核心啟動子元件是保證基礎(chǔ)水平轉(zhuǎn)錄所必須的最少的DNA序列,包括轉(zhuǎn)錄起始位點和TATAbox。上游啟動子元件決定著轉(zhuǎn)錄起始的頻率與效率,包括GCbox和CAATbox。在轉(zhuǎn)錄起始時需要其他的蛋白質(zhì)因子參與,這些蛋白質(zhì)因子稱為轉(zhuǎn)錄因子。現(xiàn)在是83頁\一共有97頁\編輯于星期五真核生物的RNA聚合酶有三種,其中RNA聚合酶Ⅱ負責(zé)mRNA的合成,對應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子為轉(zhuǎn)錄因子II,為反式作用因子。反式作用因子與啟動子親和力高,則表明此啟動子有很高的轉(zhuǎn)錄起始效率。增強子是順式正調(diào)控元件,對基因轉(zhuǎn)錄有極強的激活作用?,F(xiàn)在是84頁\一共有97頁\編輯于星期五3.6.3克隆基因在轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控真核生物的mRNA加工包括三個內(nèi)容:5′端加帽、3′端加尾、RNA剪接。由于原核生物沒有切除內(nèi)含子的能力,因此當(dāng)用原核生物表達真核基因時,應(yīng)先從真核細胞中分離mRNA并反轉(zhuǎn)錄為cDNA,cDNA有完整的編碼序列但無內(nèi)含子,將cDNA與載體連接導(dǎo)入原核細胞中表達?,F(xiàn)在是85頁\一共有97頁\編輯于星期五3.6.4克隆基因在翻譯水平的表達與調(diào)控翻譯是基因表達的最后一個階段,翻譯的效率會受翻譯起始復(fù)合物的形成、mRNA的穩(wěn)定性、密碼子偏愛性、反義RNA、翻譯起始因子的修飾等因素影響。現(xiàn)在是86頁\一共有97頁\編輯于星期五(1)原核生物在翻譯起始的調(diào)控起始密碼子AUGSD序列融合蛋白被認為是避免細菌蛋白酶破壞的最好選擇在插入真核基因時,閱讀框應(yīng)與原核DNA片段的密碼子閱讀框一致,翻譯時才不致產(chǎn)生閱讀框改變的情況現(xiàn)在是87頁\一共有97頁\編輯于星期五(2)真核生物在翻譯起始的調(diào)控mRNA5′端先與翻譯起始因子中的CBP(capbindingprotein,帽子結(jié)合蛋白)結(jié)合然后eIF-4A和eIF-4B與之結(jié)合,為小亞基提供結(jié)合位點,形成40S-Met-tRNAiMet-eIF-3與eIF-4A和eIF-4B形成復(fù)合物接著此復(fù)合物從帽子結(jié)構(gòu)開始沿著mRNA掃描,尋找起始密碼子AUG?,F(xiàn)在是88頁\一共有97頁\編輯于星期五作為起始密碼子的AUG兩側(cè)翼序列有兩個保守堿基,AUG上游3個堿基位必定是A,少數(shù)情況下是G,而下游4個堿基位必定是G。這段序列(NNPuNNAUGG)對翻譯很重要,稱為Kozak序列。當(dāng)掃描時遇到了具有Kozak序列的AUG時,復(fù)合物在此處停留下來,60S大亞基結(jié)合,形成翻譯起始復(fù)合物?,F(xiàn)在是89頁\一共有97頁\編輯于星期五(3)反義RNA反義RNA
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